Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSTF3Q12996 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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