Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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KCNH2Q12809 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCNH2Q12809 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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