Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EXOSC9Q06265 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms