Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN2Q02246 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN2Q02246 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN2Q02246 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms