Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BNC1Q01954 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BNC1Q01954 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms