Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms