Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFA6Q01524 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms