Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAE1P78406 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAE1P78406 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAE1P78406 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms