Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBG1P69891 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBG1P69891 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HBG1P69891 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms