Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA1P68133 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACTA1P68133 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms