Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HERVK_113P63121 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms