Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTBP60709 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTBP60709 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms