Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ROMO1P60602 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms