Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFRD-1P60508 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms