Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA3P59666 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA3P59666 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms