Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRISP1P54107 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms