Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RAB5CP51148 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB5CP51148 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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