Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PPT1P50897 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms