Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FNTAP49354 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms