Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCLMP48507 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCLMP48507 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms