Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIP4K2AP48426 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIP4K2AP48426 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms