Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CAPGP40121 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAPGP40121 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CAPGP40121 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CAPGP40121 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAPGP40121 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAPGP40121 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms