Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GGCXP38435 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms