Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP62P37198 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP62P37198 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms