Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SPRR1AP35321 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms