Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SFTPDP35247 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SFTPDP35247 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms