Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OTX2P32243 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
OTX2P32243 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
OTX2P32243 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OTX2P32243 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms