Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFNP31947 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFNP31947 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SFNP31947 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SFNP31947 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SFNP31947 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SFNP31947 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SFNP31947 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms