Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASQ1P31415 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASQ1P31415 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms