Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXA10P31260 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms