Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLD1P28340 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLD1P28340 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLD1P28340 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLD1P28340 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLD1P28340 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLD1P28340 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLD1P28340 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms