Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NMBRP28336 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NMBRP28336 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMBRP28336 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMBRP28336 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NMBRP28336 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NMBRP28336 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms