Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ABCD3P28288 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ABCD3P28288 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms