Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB9P28065 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB9P28065 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms