Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USF1P22415 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USF1P22415 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USF1P22415 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USF1P22415 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF1P22415 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USF1P22415 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms