Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF3P18847 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF3P18847 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF3P18847 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATF3P18847 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF3P18847 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms