Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RCC1P18754 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RCC1P18754 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RCC1P18754 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms