Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCK1P16333 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCK1P16333 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCK1P16333 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCK1P16333 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NCK1P16333 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NCK1P16333 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NCK1P16333 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms