Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPBP14678 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPBP14678 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms