Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GP1BBP13224 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GP1BBP13224 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms