Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
IFITM1P13164 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms