Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
VPREB1P12018 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms