Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LAMP1P11279 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LAMP1P11279 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms