Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLUP10909 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLUP10909 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLUP10909 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLUP10909 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms