Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX5BP10606 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX5BP10606 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX5BP10606 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX5BP10606 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX5BP10606 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX5BP10606 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COX5BP10606 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms