Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCL3P10147 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCL3P10147 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms