Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GLI4P10075 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GLI4P10075 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GLI4P10075 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GLI4P10075 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GLI4P10075 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GLI4P10075 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms