Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2BP0DI82 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2BP0DI82 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms