Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRAPPC2P0DI81 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2P0DI81 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms