Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4AP0C0L4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4AP0C0L4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms